In PLANET DER AFFEN: SURVIVAL, dem dritten Kapitel der hochgelobten Blockbuster-Franchise, werden Caesar und seine Affen in einen tödlichen Konflikt mit einer Armee von Menschen unter der Leitung eines rücksichtslosen Colonels getrieben. Nach schweren Verlusten auf Seiten der Affen kämpft Caesar mit seinen dunkleren Instinkten und beginnt seinen eigenen mystischen Kampf um Rache für die Seinen. Als Ceasar und der Colonel sich schließlich von Angesicht zu Angesicht gegenüberstehen, beginnt ein epischer Kampf, der über das Schicksal beider Spezies und die Zukunft des Planeten entscheiden wird.

Seit der Freisetzung des genmanipulierten Virus sind einige Jahre vergangen. Affe Caesar will nun mit seiner Kampftruppe die Menschheit endgültig besiegen. Doch die Rolle des Anführers wird bald zu Caesar großer Herausforderung. Auch alle Versuche der letzten überlebenden Menschen, ein Friedensabkommen mit den intelligenten Affen zu schließen, scheitern. Nun sucht eine kleine Gruppe von Wissenschaftler in San Francisco nach einer Lösung, doch alles deutet darauf hin, dass ein finaler Krieg droht.

Will Rodman erforscht mit seinem Vater Heilmittel für Menschen. Er ist ein junger und engagierter Wissenschaftler, der seine Hoffnungen in ein Mittel setzt, dass er an Affen aufprobiert. In dem modernen Labor, in dem die beiden arbeiten, lebt auch Caesar, ein besonderer Affe, der Will schon ans Herz gewachsen ist. Das getestete Mittel funktioniert nicht nur, es bringt auch unerwartete Reaktionen mit sich. Diesen muss Will jetzt auf den Grund gehen, unterstützt von der Primatenforscherin Caroline. Sie müssen sich nicht nur mit den Ursachen der Nebenwirkungen beschäftigen, sondern auch mit den Folgen...